La Escuela Básica “San Sebastián de Maquehue” fue fundada el año 1985 por la Sra. Oliva Albertina Cortesi Giacomozzi, propietaria y sostenedora, funcionando primero en el sector rural de Maquehue, para después trasladarse hasta la ubicación actual. La escuela comenzó con un solo pabellón, con una baja matrícula proveniente de sectores rurales y poblaciones periféricas de la comuna de Padre Las Casas. El año 1991 se constituyó la Sociedad Educacional “San Sebastián” Limitada, asumiendo como sostenedora del establecimiento. Con el paso de los años fue aumentando la matrícula y se fueron construyendo los otros pabellones hasta llegar a conformar la estructura actual.

A partir del año 2009 se da inicio al proceso de mejoramiento de la gestión institucional, a través de las diferentes etapas del Plan de Mejoramiento Educativo (PME – SEP) y a partir del año 2015 dando respuesta a los lineamientos del Mineduc, el establecimiento educacional establece su plan estratégico con objetivos y metas a cuatro años.

La Escuela “San Sebastián de Maquehue” atiende principalmente a una población escolar conformada por niños y niñas que provienen de sectores rurales y sectores urbanos, especialmente vulnerables, de la comuna de Padre Las Casas, siendo la gran mayoría de las familias conformadas por personas trabajadoras modestas, sencillas, de niveles socio-económicos y culturales bajos, con un importante porcentaje de descendientes de la etnia mapuche, que con esfuerzo, y con la ayuda de los beneficios que se entregan en el establecimiento, educan a sus hijos e hijos con poco compromiso con el proceso educativo y sin apoyarlo en su verdadera dimensión.